王启明教授课题组研究成果报道:两个外担菌目植物致病菌完整基因组绘制

高质量的参考基因组是了解基因组特征、植物相互作用机制和系统进化的前提。外担菌属(Exobasidium)隶属于黑粉菌亚门外担菌目,包含170多个植物致病种,其中很多种是世界性的植物病原菌,主要寄生在杜鹃花科、山茶科等木本植物上。感染这些病原体的植物通常表现出叶片病变、叶片和花瘿,严重影响宿主的经济价值和观赏价值。系统发育研究表明外担菌属与杜鹃花科等寄主存在协同进化。然而,包括外担菌属在内的外担菌目类群没有高质量基因组数据,限制了该类致病真菌致病机理、进化和病害防治的研究。

王启明课题组首次报道了基于三代PacBio长读测序和二代Illumina短读测序技术进行全基因组从头组装,完成了外担菌属两个重要病原菌Exobasidium rhododendriExobasidium cylindrosporum的染色体水平基因组组装和注释,并分别以“The First Complete Genome Resource for the Plant Pathogenic FungusExobasidium rhododendri”和“The Completed Genome Data of the Pathogenic FungusExobasidium cylindrosporum”为题分别发表在农林科学领域Top期刊《Phytopathology》和《Plant disease》上,以上两个完整基因组为该病原体与相关宿主相互作用的遗传和防治研究打下了坚实的基础,填补了外担菌目类群的高质量基因组的空白。

2021级刘菲博士和2020级李瑶瑶硕士分别以上两篇文章第一作者,王启明研究员为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金项目31961133020和科技部基础专项2021FY100900等项目的支持。

原文链接:

https://apsjournals.apsnet.org/doi/epdf/10.1094/PHYTO-08-22-0301-A

https://apsjournals.apsnet.org/doi/10.1094/PDIS-01-22-0208-A

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